羊肚菌的大小有品种差异，如同一品种的话，小个的羊肚菌比大个的羊肚菌好一些，太大的羊肚菌就比较老了；另外野生羊肚菌相对于人工的个头相对较小，颜色相对较淡，但野生羊肚菌香味浓于人工羊肚菌，而且口感更细嫩，不过从营养成分上和食用价值上来说没什么区别（因为羊肚菌完全人工种植尚无法实现，现在是半野生种植，即人工协助其在半野生环境下繁殖生长以增加其产量）。