扬州市中医院始建于1978年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、文化宣教于一体的国家三级甲等中医医院，是南京中医药大学附属医院、扬州大学临床中医学院，国家首批中医住院医师、全科医师规范化培训基地，全国首批中医诊疗模式19家创新试点单位之一，江苏省中医药文化宣传教育基地，扬州市中医药适宜技术培训基地、扬州市肿瘤诊疗中心和扬州市颈肩腰腿痛一体化诊疗中心。

2019年医院门诊量54.36万人次，中医诊疗51.81万人次，中医药业务收入10095.76万元，中草药收入5295.54万元，中成药收入2763.62万元，中药收入占药品收入53.37%；中医非药物疗法收入2036.61万元，中医收治住院病人19478人。

医院设有扬州市名医馆及急诊、内、外、妇、儿、骨伤、针灸、肿瘤等一级临床科室22个，心病科、脾胃病科、肺病科、脑病科、泌尿外科等二级专科33个，常年开放专科专病门诊91个。其中，肿瘤科是国家临床重点专科、国家中医药管理局重点专科、省中医药重点学科、扬州市“科教兴卫”工程医学重点学科；骨伤科、脑病科、肺病科、脾胃病科是省级中医重点专科；肾病科、泌尿外科、针灸科、心病科、耳鼻喉科是市级重点专科。